Tekerlekli sandalyeyle İzmir Adliyesi'ne getirilen Bozkurt, savcılıkta yaklaşık 6 saat süren sorgusunun ardından 'silahlı terör örgütü üyesi olmak' suçlamasıyla sevk edildiği nöbetçi mahkeme tarafından tutuklanarak cezaevine gönderildi.
Konuya ilişkin Erzincan Cumhuriyet Başsavcılığı'nın yürüttüğü soruşturma kapsamında 26 Şubat 2016'da gözaltına alınan Bozkurt, 'yalancı gizli tanıklık yapmak ve hürriyeti tehdit' suçlarından adliyeye sevk edilmiş, nöbetçi Sulh Ceza Hakimliği'nce adli kontrol şartıyla serbest bırakılmıştı.
Erzincan Cumhuriyet Savcılığı tarafından bu soruşturmaya ilişkin hazırlanan iddianamenin Erzincan Ağır Ceza Mahkemesi'nce kabul edilmesinin ardından Bayram Bozkurt hakkında yakalama kararı çıkarılmıştı.
İzmir İstihbarat ve Terörle Mücadele Şubesi ekipleri, hakkında İzmir'deki Fetullahçı Terör Örgütü/Paralel Devlet Yapılanması (FETÖ/PDY) soruşturması kapsamında gözaltı kararı verilen ve Erzincan'daki soruşturmayla ilgili de yakalama kararı bulunan Bayram Bozkurt'un Bornova ilçesinde bir evde saklandığını tespit ederek 5 Eylül'de operasyon düzenlemişti. Bozkurt'un, polislerden kaçmaya çalışırken düşerek ayağı kırılmıştı. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'ne kaldırılan ve ameliyat geçiren Bozkurt, tedavisinin ardından Terörle Mücadele Şube Müdürlüğü ekipleri tarafından gözaltına alınmıştı.